O Mercado atual foi inaugurado em 05 de fevereiro de 1899 (ala norte) e teve uma segunda ala (sul) aberta em 24 de janeiro de 1931. A partir da inauguração da segunda ala, podemos buscar um panorama até os dias atuais, encontrando fatos relevantes que transformaram completamente a estrutura física e social do Mercado Público. O primeiro foi a instalação das câmaras frigoríficas em 1939, que fez com que os alimentos em decomposição não fossem mais jogados ao mar como de costume, deixando de atrair multidões de famintos para o local.

Em seguida, no final da década de 1960 e início da década de 1970, o fechamento do porto, a construção dos aterros e a instalação das primeiras grandes redes de supermercados, tiraram do Mercado a função de abastecedor quase que exclusivo da cidade. No mesmo momento, o incremento do turismo em Santa Catarina, que fez com que os grupos dirigentes buscassem incluir o mercado em um rol de atrações turísticas, com a instalação no local de bares, restaurantes e lojas de artigos importados.

O cenário de momento mostra a parte final da transição que vem desde o surgimento das grandes redes de supermercados em Florianópolis. Com o fechamento do porto, o rompimento da relação direta com o mar e a perda de sua original função de abastecimento de gêneros alimentícios para a população, ocorreu nos corredores e nos 118 boxes (79 na Ala Norte e 39 na Ala Sul) do Mercado um processo de elitização que, acompanhado do crescimento da exploração turística, consistiu na criação de locais dentro do Mercado que atendessem aos desejos das classes mais altas da população.